Récemment, une série de problèmes directement en relation avec des sources sonores d'origine humaine, comme l'augmentation de la mortalité des cétacés par collisions avec des navires ou l'échouage en masse de baleines au cours de manoeuvres militaires, est apparue au grand jour. Même s'il n'existe pas encore de données définitives sur l'implication que la pollution sonore de moyennes et basses fréquences présente dans désorientation et la mort de ces animaux, il est désormais accepté que les effets négatifs du bruit répercutent de façon irréversible sur leurs capacités auditives.

Le Laboratoire d'Applications Bioacoustiques analyse de forme routinière les structures internes des oreilles des cétacés échoués, conçoit et améliore en permanence ses méthodes d'analyse. Les échantillons son analysées et préparées pour des études histopathologiques, microbiologiques, toxicologiques et parasitologiques ainsi que pour le traitement para microscopie électronique de balayage et images (CT scans et MRI).

Les résultats de cette recherche, en plus de permettre la détection de lésions induites par des sources acoustiques, sont modélisées et intégrées dans les simulations du LAB dans le but de déterminer les mécanismes de production, propagation et réception des sons, comme les effets pathologiques du bruit d'origine anthropogénique dans ces processus.